FolderFresh eignet sich ideal für Verzeichnisse, in denen regelmäßig unterschiedlichste Dateitypen abgelegt werden. Das Programm erstellt automatisch thematische Unterordner und sortiert Dokumente, Archive, Bilder, Videos und mehr entsprechend ein. Bei Bedarf können Sie zunächst die voreingestellten englischen Kategorienamen anpassen. Anschließend wählen Sie das Verzeichnis sowie optional inklusive seiner Unterordner aus, das strukturiert werden soll. Nach einer übersichtlichen Vorschau aller geplanten Aktionen starten Sie den Vorgang mit "Jetzt organisieren". Jedem erstellten Profil lassen sich zudem flexibel weitere Regeln und Voreinstellungen hinzufügen, um die Organisation individuell anzupassen.

Dateien lassen sich damit je nach vorgegebener Bedingung umbenennen, löschen, in ein Archiv packen, kopieren statt verschieben, mit einem Tag versehen und mehr. Ein besonderes Highlight ist die Funktion 2Enable watching". Damit überwacht das Programm einen oder mehrere Ordner im Hintergrund und verschiebt neu hinzugekommene Dateien automatisch in die passende Kategorie. Über "Undo" lässt sich die zuletzt ausgeführte Aktion bei Bedarf schnell rückgängig machen. In den Einstellungen können Sie außerdem festlegen, ob FolderFresh automatisch mit Windows starten soll, die Benutzeroberfläche auf Deutsch umstellen sowie bestimmen, ob System- und versteckte Dateien bei der Verarbeitung ignoriert werden.